Se vc deixar de mencionar a fonte do dinheiro (a herança) com o qual comprou o novo bem, sim, ela terá direito.

Então como devo proceder para deixar claro que é procedente de herança ? que tipo de documento me resguardo em relação a isso?

Na escritura do imovel que vc vai adquirir que seja gravada cláusula a cerca da origem dos recursos, mencionando que é proveniente de herança recebida por espólio de seu pai na data tal e tal.