você esta falando hipoteticamente em caso de divorcio, ou realmente estão se separando? depende da situação do antes e depois... antes da separação não é bom fazer a transferência ...

Estamos pensando em separação, já estamos vendo advogado, porem ainda não entregamos a documentação

Então o correto e fazer a separação e depois a transferência? Mas é possível fazer a transferência de imóvel financiado pela caixa? Ou terei que simular uma venda e refinanciar o apartamento?

se a separação é consensual e vc trabalha e tem comprovante de renda...basta colocar na acao do divorcio que as parcelas do imóvel fica na sua responsabilidade....

Isso quem pode dizer é o agente financiador, ele terá de reavaliar o crédito daquele que pretende assumir o financiamento.