Boa tarde, Júnior! Se realmente foi dado baixa no CNPJ do MEI, e partindo do princípio de que você foi demitido sem justa causa e cumpriu os requisitos para receber o seguro-desemprego, você vai ter sim direito ao seguro (Lei 7.998/90, art. 3º, V). Se você ainda não tivesse dado baixa no CNPJ do MEI, você estaria correndo o risco de não receber o benefício.
Espero ter ajudado!

Boa tarde Dr. Carlos

Fui no contador e solicitei que ele desse baixa no cnpj, quando faço uma consulta no site da receita , consta ali na situação cadastral como Baixada , será q estaria tudo certo ?

Boa noite! Considerando que foi dado baixa no CNPJ do MEI e depois a demissão sem justa causa sua da empresa, eu entendo que você tem direito ao seguro-desemprego.