E por qual motivo vcs querem reter tal documento? O documento é dele, mesmo que vcs tenham pago, esta em nome dele, sendo assim, vcs não podem se apropriar de algo alheio.

Por que a empresa pagou o curso, afim de qualifica-lo na sua função.. ainda assim entregamos o certificado ao funcionário correto?

Vcs terem pago o curso não os tornam donos do documento que está em nome de outra pessoa. Sendo assim, terão sim que entregar o certificado ao dono.

Correto, agradecido pelas informações!