Se faleceu não há que se falar em isenção.

Exatamente.

Isenção de impostos é para os vivos. E somente se eles (os vivos) se enquadrarem nos requisitos legais para receberem a isenção.

E como faz agora? meu avô é falecido e o IPTU do imovel esta nome dele como fazer?

Tem que fazer é o inventário e havendo partilha cada herdeiro resolve na prefeitura.

IPTU é dívida do imóvel e fica vinculado ao imóvel e não ao CPF do dono. Façam inventário e já te adianto que se esse imóvel for indiviso não adianta algum herdeiro tentar pagar só a sua parte. O imóvel responde pela dívida.